Наиболее часто в древесине встречаются трещины. Они образуются по мере роста дерева, а также при неправильной сушке древесины или неправильном хранении уже обработанной древесины. Причиной появления трещин в стволе дерева являются природные факторы и внутреннее напряжение ствола. Трещина могут быть морозными, отлупными или метиковыми. Морозные трещины могут быть вызваны расширением влаги внутри ствола при низких температурах. Обычно такие трещины являются сквозными и направлены радиально. Отлупные и метиковые трещины возникают в результате внутреннего напряжения дерева. В первом случае отслаиваются годичные слои, а во втором древесина трескается вдоль ствола снизу доверху.
Сучки также снижают ценность древесины, поскольку в местах их расположения прочность материала снижена. Внешний вид текстуры из-за этого портится, особенно если древесина имеет прозрачную отделку.
Еще одним пороком древесины является косослой. Это отклонение в росте волокон от вертикальной оси ствола. Древесина с косослоем очень непрочна, она может выдержать лишь небольшую поперечную нагрузку.
Механические повреждения ствола являются причиной возникновения прорости. Прорость портит качество древесины и затрудняет его дальнейшую отделку.
Из-за имеющихся в древесине гнилостных процессов может появиться грибок. Он снижает качество древесины, ухудшает ее свойства и меняет цвет дерева.